门店被某某因过期食品罚款后，是否合法？

不合法。依据《中华人民共和国食品安全法》，食品过期罚款应由公司承担，员工无责任支付。若强迫员工支付，可能引发劳动争议及法律纠纷，影响公司声誉。
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不合法。应对如下：1.与公司沟通，明确罚款责任归属公司；2.若沟通无果，可申请企业劳动争议调解；3.调解不成，向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；4.对仲裁结果不服，可向人民法院提起诉讼，维护自身权益。
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公司不应让员工支付罚款，常见处理方式是公司自行承担罚款，并加强食品管理。若员工被错误追责，可与公司协商或申请劳动仲裁来维权。